
По результатам историко-культурной экспертизы Митрофаниьвское кладбище со всеми здания на его территории включено в единый госреестр объектов
памятников истории и культуры в качестве объекта культурного наследия регионального значения.
Согласно распоряжению, подписанному и.о. председателя комитета по государственному контролю, использованию и охране памятников истории и культуры Петербурга Александром Леонтьевым, охраняемый ансамбль расположен на Митрофаньевском шоссе. Он включает в себя само кладбище, церковный дом, здание церковно-приходской школы, дом причта, склеп и памятные места — храма св. Митрофана Воронежского, церкви Всемилостивого Спаса, церкви Сошествия Святого Духа и Семи отроков Эфесских (Кекинской), часовен, церковного дома с часовней и службами Лютеранского кладбища, склепа над могилой вице-адмирала Головнина и его семьи.
В течение двух месяцев в Министерство культуры будет направлено заявление о кладбища в реестре объекта культурного наследия.
Митрофаньевское кладбище не раз становилось объектов споров из-за возможного строительства на его территории.
В 1997 году появились планы офисно-деловой застройки, получившие название "Измайловская перспектива".